Главни алергени на јесен су полени, гриње, калуп итд.
У многим регионима, врсте и количине алергене полена постепено се повећавају након почетка јесени, улазећи у врх алергија на полен. Поред тога, алергени за полен у јесен су углавном корови полен, који има јачу алергеност.
Главни извори јесењих полена укључују биљке артемисије (као што су Артемисиа Аннуа), биљке ЦхеноподиаЦеае (као што су сиво поврће) и биљке рагвееда. Међу њима, полен артемисијске биљке посебно је активан на јесен, а неки могу да доживе озбиљне алергијске реакције са само малом количином АРТЕМИСИЕ полена.
Поред тога, влажност и температура крајем лета и ране јесени стварају повољне услове за гриње и такође су веома погодни за раст калупа. Јесењи јутарње росе или заостале кише, пали лишће и распадање вегетације може промовисати раст калупа. Када људи долазе у контакт са спорама или удишемо споре, они су такође склони алергијама.
У исто време, након температуре падне на јесен, време постаје суво и количина малих честица попут прашине у ваздуху расте, постајући важни алергени. Велика температурна разлика између дана и ноћи у јесени и стимулација хладног ваздуха на носној слузокожној монсији може довести до васоконстрикције и смањене баријерне функције, индукује осетљивост.

